北京大学深圳医院感染性疾病科成立于2000年，是广东省高水平医院建设单位重点学科。
科室目前诊疗团队有20位医护人员，其中博士4名，硕士6名，博士后1名，博导1名，硕导1名，主任医师4名，副主任医师2名；科室相关人员分工合作，分别负责临床、教学、科研等多重工作任务。学科带头人、科主任系全国重型肝炎肝衰竭专业委员会委员、广东省医师协会肝病专科医师分会疑难肝病专业组组长。临床上，我科拥有先进的“非生物型人工肝”、肝储备功能测定、无创肝纤维扫描、体脂测定等设备。
本科室开设了肝炎肝硬化门诊、脂肪肝门诊、乙肝妊娠门诊、病毒性肝炎预防接种咨询门诊、及肝脏占位性病变专家联合会诊门诊、肝移植术后随访管理等专科门诊。长期从事各型急/慢性肝炎、肝衰竭人工肝治疗、肝功能异常查因、黄疸查因、肝脏占位病变性质鉴别、发热查因、腹泻查因、人体寄生虫病、肠道感染性疾病及其他传染性疾病、新发传染病等的临床诊治工作，是省内重要的感染性疾病临床医疗中心。尤其针对疑难复杂肝脏疾病，可以进行超声引导下肝脏穿刺术明确肝脏病理，进一步联合多学科进行疑难肝病的联盟会诊。针对肝衰竭等急危重患者，能够有效进行人工肝的积极救治。
未来，感染性疾病科将建设“疑难肝病诊治与研究中心”、“肝纤维化临床转化诊治平台”等一流学科平台，形成对深圳市及周边省市的区域性影响力，将努力把本科室建设成为广东省感染性疾病重点专科。