北京大学深圳医院内分泌代谢科成立于1999年8月。20余年来立足深圳、辐射珠三角，学科不断发展，2012年被评为广东省临床重点专科， 2016年被深圳医管中心认定为品牌学科，2020年被认定为深圳市重点医学专科。
内分泌科共有医生19人，护士19人。正高级职称4人，副高级职称8人，中级职称15人，博士4人，硕士12人。常年开放内分泌专科门诊及糖尿病、甲状腺病、减重、骨代谢疾病、护理等专病门诊，每天有4-8名专科医师和1名专科护士出诊。病房固定病床42张，年收治病人2千余人次，年门诊量89万余人次，承担或指导市内外各级医院的危重疑难病例会诊、抢救工作。
内分泌科配备动态血糖监测系统、胰岛素泵治疗设备、糖尿病神经病变检查仪、神经源性膀胱治疗仪及经皮氧分压检测仪等设备，擅长糖尿病患者强化管理、胰岛素泵治疗及动态血糖监测。
内分泌科成立专病学组，发展专病特色诊疗。目前已成立1.糖尿病及其慢性并发症学组；2.代谢减重学组；3.甲状腺疾病学组；4.代谢性骨病学组；5.垂体肾上腺疾病学组；6.性腺疾病学组；7.护理学组。各学组由专科带头人及青年业务骨干组成，在专病的健康教育、医疗服务、科研教学等方面全面发展。
内分泌科坚持“预防为主、防治结合”的医疗理念，为患者义务开展代谢性疾病健康教育，现有"糖尿病健康俱乐部"、"痛风病友俱乐部"、"甲状腺病友俱乐部"等，定期开展健康讲座。在联合国糖尿病日、世界骨质疏松日等开展义诊咨询等活动，受到市民欢迎。
在科室领导和全科医护人员的共同努力下，内分泌科医疗、教学、科研全面发展，先后被评为广东省"巾帼文明岗"、深圳市"巾帼文明岗"、深圳市"青年文明号"、院级先进集体、先进党支部等。
未来，内分泌科将在糖尿病及内分泌系统疾病基础与临床研究等多方面进一步发展提升，为患者提供优质的医疗服务，同时加强健康教育，为广大市民送去健康知识。