北京大学深圳医院运动医学科创建于2007年，2012年正式成立运动医学与康复科并拥有独立病区，设置床位45张，2018年成立运动医学与康复医学中心，设置床位72张，现已发展成为集运动损伤手术治疗与功能康复为一体的运动医学专科。
目前，科室是广东省重点医学学科，在运动损伤手术治疗、运动康复、运动处方、赛事保障、运动损伤防治科普等处于国内领先水平。
科室现有医务人员37人，包括医师10人，护士26人，培训医师15人，医辅人员1人；博士学历9人，硕士学历2人；高级职称5人，中级职称20人。科室人员多次赴国内外知名医院及院校研修。目前科室配备多台最新关节镜手术系统，各类关节镜手术器械以及运动损伤康复治疗设备。
科室优势技术和特色诊疗项目包括：
1.运动损伤手术治疗。设有全关节组、髋膝组、肩膝组、踝膝组、青少年运动损伤组五个专业组，特长突出，专病专治，科室门诊量4万人次/年，手术量超过2000例/年，位居广东省前列，尤其在前交叉韧带重建、半月板修复移植、臀肌挛缩松解、肩关节脱位稳定术、关节镜在关节外的应用等高难度手术方面均达到国内领先水平，承担华南运动医学及关节镜手术专业人员的技术培训。
2.运动康复。担任全国运动康复学组副组长单位、深圳市骨科康复与运动康复专科联盟牵头理事长单位，引领打造国内手术康复一体化的先进模式，构建了运动损伤“预防—保守康复—手术—术后早期康复—重返运动”一站式诊疗平台。
3.运动处方。积极推广常见慢性病运动干预，开设深圳市首家“运动促进健康（运动处方）”门诊，获得“深圳市体医融合先行示范点”、“深圳市（运动促进健康）科普基地”。
4.赛事保障。承担WTA总决赛、深圳国际马拉松等国际赛事医疗保障工作，承担了在深国家队运动损伤医疗保障，同时培养优秀的运动医学及运动康复临床人才。
5.运动损伤防治科普。以保障全民运动健康为己任，通过各种媒介途径积极宣传运动损伤防治知识，获得“广东省运动损伤防治科普基地”。
未来，科室将继续推动关节镜微创技术在运动损伤以及关节外的应用，坚持功能至上的原则，利用运动损伤手术治疗与功能康复一体化管理，促进患者早日重返社会、重返运动。同时将全面普及科学运动知识、倡导运动促进健康的理念，助力实现健康中国战略，推动全民健身运动新发展。